More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1207 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0658  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35 
 
 		 325 aa  92.8  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  26.54 
 
 		 330 aa  92.8  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  23.78 
 
 		 368 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  23.93 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  34.56 
 
 		 333 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  31.69 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  24.78 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  27.15 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  31.54 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  29.61 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1419  transcriptional regulator, AraC family  23.08 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00505932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  23.15 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4154  AraC family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  36.09 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  24.04 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  30.66 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0392  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  34.72 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  23.25 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  19.62 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0862  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  25.36 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  23.78 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.46 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2517  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.56 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  21.57 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  26.36 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  26.36 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  26.67 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4585  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0477904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  26.36 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  26.36 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  22.28 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.49 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1822  transcriptional regulator, AraC family  20.83 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  23.76 
 
 		 141 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2150  transcriptional regulator, AraC family  22.93 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28417  normal  0.200659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  22.44 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  22.52 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2168  transcriptional regulator, AraC family  20 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  28.36 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1500  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.546441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.11 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>