More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0308 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
324 aa  656    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 
320 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0304  transcriptional regulator, AraC family  35.74 
 
 
336 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  33.5 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 
387 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1482  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 
345 aa  87.4  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  44.68 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  44.68 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  44.68 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.07 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.07 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.07 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  22.83 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  31.93 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  35.22 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  37.19 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00477  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  34.4 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  20.72 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  43.37 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  38.46 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  37.01 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  32.04 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  38.32 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  36.92 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  28.78 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2321  transcriptional regulator, AraC family  42.57 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.612609 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  20.1 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.95 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  43.62 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1619  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.58 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  33.93 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 
513 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0706  transcriptional regulator, AraC family  29.58 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0374737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0658  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  31.87 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  35.19 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17740  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.27 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.743146  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 
271 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 
289 aa  67  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  29.81 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  29.81 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  31.02 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  38.32 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1147  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  39.67 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  26.11 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  23.64 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  22.89 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.83 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  33.58 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  28.3 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 
277 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0100  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 
252 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  50.77 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  27.61 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3306  transcriptional regulator, AraC family  24.43 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  30.83 
 
 
198 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 
133 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>