More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0392 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0392  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  657    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0658  AraC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1419  transcriptional regulator, AraC family  36.33 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00505932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1822  transcriptional regulator, AraC family  33.88 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  30.6 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  37.61 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  30.3 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  24.25 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  25.17 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  34.86 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  31.14 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4328  AraC-like transcriptional regulator  36.46 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  33.03 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 357 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  35.71 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  33.08 
 
 		 343 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  29.01 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  36.46 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 377 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2738  AraC-type transcriptional regulator domain protein  31.62 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0723  AraC-like transcriptional regulator  30.1 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  32.65 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4209  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4732  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583037  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3531  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5449  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109166 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4835  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  34.29 
 
 		 993 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0864  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0736  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  27.65 
 
 		 1374 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  30.83 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  30.83 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.21 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  30.83 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  33.71 
 
 		 1347 aa  63.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0694  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1163  AraC-type transcriptional regulator domain protein  34.02 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000040891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3237  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3397  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0407  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0923  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139126  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1153  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0088  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90451  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1008  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.351707  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1528  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.836546  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2251  AraC family transcription regulator  29.1 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1981  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  29.35 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  31.73 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  25.21 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  28.21 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>