More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2251 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0923  AraC family transcriptional regulator  99.69 
 
 
327 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139126  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1153  AraC family transcriptional regulator  99.69 
 
 
325 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2251  AraC family transcription regulator  100 
 
 
390 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1528  AraC family transcriptional regulator  99.69 
 
 
325 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.836546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1008  AraC family transcriptional regulator  99.69 
 
 
325 aa  653    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.351707  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0088  AraC family transcriptional regulator  99.39 
 
 
327 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90451  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  93.96 
 
 
331 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0864  AraC family transcriptional regulator  74.49 
 
 
320 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13712 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  74.58 
 
 
320 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4732  AraC family transcriptional regulator  75.68 
 
 
308 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583037  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4209  AraC family transcriptional regulator  75.68 
 
 
308 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378308  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3531  AraC family transcriptional regulator  73.74 
 
 
307 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4835  AraC family transcriptional regulator  73.74 
 
 
307 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108272 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5449  AraC family transcriptional regulator  72.73 
 
 
307 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0109166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1890  AraC family transcriptional regulator  54.14 
 
 
310 aa  302  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  48.95 
 
 
307 aa  292  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  46.74 
 
 
312 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  48.3 
 
 
302 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  47.42 
 
 
302 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  49.83 
 
 
338 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  49.83 
 
 
338 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  49.83 
 
 
338 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  47.95 
 
 
312 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2498  transcriptional regulator, AraC family  50.7 
 
 
302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467728  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0111  AraC family transcriptional regulator  46.55 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00655283  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  49.65 
 
 
300 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5491  transcriptional regulator, AraC family  49.47 
 
 
320 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  45.36 
 
 
314 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2814  transcriptional regulator, AraC family  48.52 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00480171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  47.28 
 
 
302 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  45.39 
 
 
302 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2755  transcriptional regulator, AraC family  49.65 
 
 
302 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.877904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2576  AraC-like transcriptional regulator  48.82 
 
 
313 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.289552 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7736  AraC family transcriptional regulator  49.83 
 
 
338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 
329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  45.61 
 
 
311 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  48.64 
 
 
315 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  47.19 
 
 
309 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  48.6 
 
 
310 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  42.76 
 
 
307 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  47.04 
 
 
313 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3357  AraC family transcriptional regulator  48.79 
 
 
303 aa  255  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784583  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0625  transcription regulator protein  48.75 
 
 
321 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  44.52 
 
 
305 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  47.04 
 
 
305 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1083  AraC family transcriptional regulator  44.14 
 
 
314 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2598  transcriptional regulator, AraC family  44.41 
 
 
320 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0723  AraC family transcriptional regulator  48.81 
 
 
331 aa  250  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.065718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  47.96 
 
 
306 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  46.21 
 
 
306 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3397  transcriptional regulator, AraC family  45.93 
 
 
311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3237  AraC family transcriptional regulator  44.79 
 
 
322 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2739  transcriptional regulator, AraC family  43.24 
 
 
307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3606  AraC-like transcriptional regulator  50.35 
 
 
295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3775  AraC-like transcriptional regulator  44.21 
 
 
318 aa  242  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2981  AraC family transcriptional regulator  44.95 
 
 
321 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2283  transcriptional regulator, AraC family  45.52 
 
 
307 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4483  AraC-like transcriptional regulator  43.64 
 
 
336 aa  239  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000135378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  43.9 
 
 
307 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  45.95 
 
 
311 aa  237  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4307  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1698  AraC family transcriptional regulator  44.53 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2599  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.39443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  43.41 
 
 
312 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2712  AraC family transcriptional regulator  49.25 
 
 
299 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.974943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  44.28 
 
 
303 aa  230  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3052  AraC family transcriptional regulator  46.62 
 
 
298 aa  230  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2474  AraC family transcriptional regulator  46.32 
 
 
310 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446232  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  48.3 
 
 
306 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0360  AraC family transcriptional regulator  40.44 
 
 
313 aa  223  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000460662  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  47.96 
 
 
306 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4328  AraC-like transcriptional regulator  47.96 
 
 
306 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0694  transcriptional regulator, AraC family  45.52 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6605  AraC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
354 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0589608  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  42.18 
 
 
321 aa  219  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2236  AraC family transcriptional regulator  46.75 
 
 
272 aa  219  7e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  44.84 
 
 
303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  44.84 
 
 
303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1947  AraC-like transcriptional regulator  42.56 
 
 
303 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2948  transcriptional regulator, AraC family  45.49 
 
 
299 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0708341 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3330  AraC-like transcriptional regulator  42.16 
 
 
317 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0736  transcriptional regulator, AraC family  44.83 
 
 
303 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0968  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 
302 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0877  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 
298 aa  208  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000157744  decreased coverage  0.000000000198967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3074  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 
313 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.618991  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6678  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
373 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41036  normal  0.11497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0723  AraC-like transcriptional regulator  44.83 
 
 
303 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  38.54 
 
 
299 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 
284 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2399  AraC family transcriptional regulator  42.8 
 
 
323 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3720  transcriptional regulator, AraC family  41.39 
 
 
296 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44403  normal  0.422333 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0109  AraC-like transcriptional regulator  40.48 
 
 
299 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  hitchhiker  0.00915457 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1453  AraC family transcriptional regulator  39.12 
 
 
299 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2611  AraC family transcriptional regulator  43.01 
 
 
299 aa  202  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32460  transciption regulator, AraC-family  47.03 
 
 
269 aa  200  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6202  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724324 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5835  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 
326 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7439  transcriptional regulator, AraC family  43.21 
 
 
291 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  38.35 
 
 
299 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2598  transcription regulator protein  43.12 
 
 
299 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>