More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1123 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  93.91 
 
 		 388 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 361 aa  736    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  57.18 
 
 		 398 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  55.75 
 
 		 399 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  56.21 
 
 		 384 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  33.74 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  30.29 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4604  two component transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  31.61 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  33.57 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  23.15 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  33.11 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  30.26 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  34.46 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  32.61 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  23.88 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  32.09 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  20.27 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  33.57 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  28.19 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.58 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4154  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  32.7 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  30.05 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.81 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 321 aa  67  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  23.9 
 
 		 320 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0392  helix-turn-helix domain-containing protein  32.69 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  36.45 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 234 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1947  two component transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 252 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.272912 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  26.87 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  37.89 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.06 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000320877  normal  0.335599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  28.67 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  37.89 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  31.19 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0360  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000460662  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1946  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.73017  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  32.47 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0864  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13712 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  32.88 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0985  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.21 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1747  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  37.86 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>