More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1822 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1822  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 311 aa  648    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1419  transcriptional regulator, AraC family  79.68 
 
 		 330 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00505932  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0658  AraC family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0392  helix-turn-helix domain-containing protein  33.88 
 
 		 316 aa  165  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0730  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000385534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  36.73 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2425  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.989434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3270  AraC-like transcriptional regulator  42.53 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3072  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.675846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2070  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  20.83 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.64 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0407  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  27.42 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  38.14 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  29.13 
 
 		 1347 aa  59.7  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  31.91 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1993  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  38.64 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  0.0985954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2105  putative sigma54 specific transcriptional regulator  29.53 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.619214  normal  0.0553697 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  30.1 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0285  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000546061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  26.79 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0457  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.761894  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  31.91 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4119  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 296 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4602  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.488901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3640  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2183  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  22.75 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  30.5 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0985  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 154 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2093  helix-turn-helix domain-containing protein  37.37 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000327  transcriptional regulator AraC family  31.91 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000791228  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2063  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3721  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0850692  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4647  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.951834 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1284  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.960401  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5657  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0574  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389496  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3282  helix-turn-helix domain-containing protein  30.91 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2199  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1415  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1891  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0477  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.555067  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17740  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.33 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.743146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0885  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 358 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 256 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 328 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 273 aa  52.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  30.85 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1440  helix-turn-helix, AraC type  24.07 
 
 		 209 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3416  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 279 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0904858  normal  0.667905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5196  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 264 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82206  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4668  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 264 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.622787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>