More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0285 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0285  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 269 aa  560  1.0000000000000001e-159  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000546061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0730  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000385534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1984  transcriptional regulator, AraC family  22.34 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4585  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0477904  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3298  transcriptional regulator, AraC family  22.46 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3306  transcriptional regulator, AraC family  21.63 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3086  AraC family transcriptional regulator  21.63 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000257264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3030  AraC family transcriptional regulator  21.63 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3328  AraC family transcriptional regulator  21.63 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 515 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 332 aa  72  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  25.43 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  27.53 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39.45 
 
 		 385 aa  69.3  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  33.33 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  38.14 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1502  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 115 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182478  normal  0.0194008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  32.22 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 322 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0818  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2943  helix-turn-helix domain-containing protein  34.83 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0314532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  32.17 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  28.97 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4365  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  24.77 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  34.07 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06729  hypothetical protein  35 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.99 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  34.95 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  32.77 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2063  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.86 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.85 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3282  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 1201 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0477  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.555067  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1415  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0574  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389496  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1891  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 517 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0885  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2199  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4131  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5544  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 		 463 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258636  normal  0.142482 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2677  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.84 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 361 aa  62.4  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  27.82 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 323 aa  62  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  32.99 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1546  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000827637  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>