More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0985 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0985  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 326 aa  680    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  24.61 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  22.4 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1299  transcriptional regulator, AraC family  21.78 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 388 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  25.14 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  26.94 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4483  AraC-like transcriptional regulator  26.57 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000135378 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 548 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5544  transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258636  normal  0.142482 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  27.74 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  27.62 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4328  AraC-like transcriptional regulator  34.83 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 530 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7736  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0625  transcription regulator protein  34.78 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  30.08 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1890  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6821  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  24.08 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  31.68 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1698  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  26.36 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1284  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.960401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0149  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  29.06 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  29.36 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4575  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1947  AraC-like transcriptional regulator  31 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2598  transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3357  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1223  transcriptional regulator, AraC family  23.56 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0726394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2474  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  31 
 
 		 537 aa  59.7  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1824  two component AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000196685  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  26.28 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7135  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  29.29 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  23.29 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3314  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>