More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6821 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6821  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 324 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0326  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.237468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 331 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  31.97 
 
 		 330 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  29.18 
 
 		 334 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 334 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  33.33 
 
 		 334 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.63 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  30.42 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  27.69 
 
 		 339 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0309  transcriptional regulator  39.04 
 
 		 320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  28.34 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 331 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.15 
 
 		 326 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  25.3 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  25.61 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  26.69 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  26.46 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 361 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 330 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  27.71 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  25.77 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  27.82 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  24.7 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  27.71 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  28 
 
 		 320 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  30.07 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.53 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.38 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2398  cyclic nucleotide-binding protein  27.79 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00401511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 335 aa  99.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  28.35 
 
 		 329 aa  99.4  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 333 aa  99  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  26.3 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.11 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.24 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 332 aa  96.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.69 
 
 		 327 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 345 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5650  AraC family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0966  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1180  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 320 aa  93.2  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.688099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0385  transcriptional regulator  25.69 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 343 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  27.39 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  30.74 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  22.49 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  24.55 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  27.95 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  28.76 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  27.78 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 351 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  26.94 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  27.07 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  27.6 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>