More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0385 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0385  transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  694    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  57.66 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  56.27 
 
 		 341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  57.53 
 
 		 331 aa  401  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 345 aa  351  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 331 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  29.08 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 306 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  28.53 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  31.28 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  28.61 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  29.14 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 341 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 326 aa  126  7e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  28.61 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  25.6 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  25.6 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  26.55 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  28.32 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  27.49 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  26.13 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.83 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.51 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0966  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 354 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 343 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  25.76 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.84 
 
 		 325 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5594  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  27.04 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  29.03 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0916  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 357 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 317 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6415  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.23 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  25.45 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  27.76 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  26.18 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.39 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  28.36 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5545  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7737  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5910  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  26.55 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.85 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  26.23 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  25.67 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  27.3 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  27.3 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>