More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6415 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6415  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 320 aa  634    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5545  AraC family transcriptional regulator  97.81 
 
 		 320 aa  593  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7737  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5910  AraC family transcriptional regulator  97.81 
 
 		 320 aa  593  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6286  transcriptional regulator, AraC family  86.88 
 
 		 320 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5594  AraC family transcriptional regulator  65.73 
 
 		 321 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5650  AraC family transcriptional regulator  54.57 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1180  AraC family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.688099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0966  transcriptional regulator, AraC family  55.84 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0916  AraC family transcriptional regulator  55.76 
 
 		 335 aa  323  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3598  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167816  normal  0.0986203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0228  ThiJ/PfpI domain protein  39.02 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000506965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5129  transcriptional regulator, AraC family  41.01 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  32.7 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  31.12 
 
 		 336 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  30.55 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  30.55 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 335 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  29.86 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 345 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 335 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  34 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  29.71 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  30.91 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 336 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 327 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  35.91 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.41 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  23.38 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  27.3 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  26.95 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.49 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  33.78 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0385  transcriptional regulator  29.97 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.43 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.19 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  25.76 
 
 		 330 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 331 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  28.78 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  29.1 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 339 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 333 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  25.84 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 344 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  30.28 
 
 		 328 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  28.64 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  25.6 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 331 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.47 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>