More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1180 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1180  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
320 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.688099  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5650  AraC family transcriptional regulator  95.94 
 
 
337 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0916  AraC family transcriptional regulator  61.2 
 
 
335 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0966  transcriptional regulator, AraC family  60.25 
 
 
354 aa  363  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5594  AraC family transcriptional regulator  53.94 
 
 
321 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6415  AraC family transcriptional regulator  52.67 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6286  transcriptional regulator, AraC family  53.31 
 
 
320 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5545  AraC family transcriptional regulator  51 
 
 
320 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7737  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5910  AraC family transcriptional regulator  51 
 
 
320 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3598  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 
313 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167816  normal  0.0986203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0228  ThiJ/PfpI domain protein  39.53 
 
 
313 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000506965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5129  transcriptional regulator, AraC family  39.87 
 
 
326 aa  188  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  31.19 
 
 
331 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  41.78 
 
 
323 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  35.42 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 
335 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
337 aa  142  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  34.01 
 
 
325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 
332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  31.21 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  30.89 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  32.97 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 
341 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 
335 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  30.89 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 
345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 
345 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 
345 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  31.77 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 
326 aa  126  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 
342 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 
341 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  28.31 
 
 
346 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  31.06 
 
 
330 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  32.33 
 
 
340 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
334 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  29.94 
 
 
335 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
334 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  30.92 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  30.71 
 
 
334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  28.95 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  30.45 
 
 
360 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  31.5 
 
 
336 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
312 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 
314 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 
329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  35.85 
 
 
331 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  31.43 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 
362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  34.42 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 
324 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.73 
 
 
326 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 
331 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  24.17 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  28.47 
 
 
320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  34.5 
 
 
318 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 
324 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  32.03 
 
 
345 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  29.14 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  38.76 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  33.8 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  25.61 
 
 
324 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.26 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.78 
 
 
327 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 
315 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  31.94 
 
 
313 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.74 
 
 
325 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  35.91 
 
 
347 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  28.75 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  34.5 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  29.71 
 
 
361 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 
343 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 
321 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  30.15 
 
 
350 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
299 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 
387 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 
316 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 
333 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  28.57 
 
 
336 aa  108  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 
332 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 
344 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 
331 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  26.28 
 
 
326 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  33.04 
 
 
322 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>