More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2003 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
342 aa  679    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  68.45 
 
 
313 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  64.35 
 
 
313 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  63.09 
 
 
316 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  62.15 
 
 
315 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  61.39 
 
 
314 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  62.66 
 
 
315 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  62.66 
 
 
315 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  62.66 
 
 
315 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  62.34 
 
 
315 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0092  AraC family transcriptional regulator  58.23 
 
 
312 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  55.42 
 
 
320 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  55.42 
 
 
320 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  55.42 
 
 
320 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0089  AraC family transcriptional regulator  58.86 
 
 
312 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0049  transcriptional regulator, AraC family  49.69 
 
 
322 aa  294  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  50.62 
 
 
340 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  51.58 
 
 
319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  48.15 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  47.53 
 
 
327 aa  269  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  47.78 
 
 
324 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  48.28 
 
 
346 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  45.82 
 
 
321 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
331 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  48.44 
 
 
321 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  47.19 
 
 
342 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 
350 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  46.27 
 
 
330 aa  258  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  48.45 
 
 
334 aa  258  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 
333 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  46.44 
 
 
350 aa  255  8e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  45.57 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  47.52 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  47.81 
 
 
324 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  45.82 
 
 
327 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  46.54 
 
 
318 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  45.06 
 
 
332 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  47.94 
 
 
333 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  44.69 
 
 
320 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  46.44 
 
 
324 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  46.03 
 
 
318 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  43.34 
 
 
347 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  47.02 
 
 
352 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  46.03 
 
 
318 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  46.03 
 
 
318 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  46.03 
 
 
318 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  46.84 
 
 
320 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  46.44 
 
 
324 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 
322 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  46.08 
 
 
325 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  45.71 
 
 
318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  45.11 
 
 
317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 
335 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  47.13 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  47.51 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  46.82 
 
 
324 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  43.11 
 
 
348 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  47.13 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  45.4 
 
 
318 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  47.13 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  44.55 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  44.79 
 
 
317 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 
320 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  44.94 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  43.22 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  45.71 
 
 
362 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  47.44 
 
 
322 aa  242  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  42.68 
 
 
337 aa  242  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  44.24 
 
 
338 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  48.44 
 
 
331 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  43.22 
 
 
335 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  43.4 
 
 
326 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  45.25 
 
 
321 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  45.51 
 
 
346 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  42.01 
 
 
326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  41.07 
 
 
326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  46.5 
 
 
320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  47.81 
 
 
337 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
330 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  45.54 
 
 
344 aa  238  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  50.16 
 
 
322 aa  238  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  44.76 
 
 
321 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  45.25 
 
 
333 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  44.87 
 
 
329 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  44.94 
 
 
321 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  44.27 
 
 
341 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  44.27 
 
 
341 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  45.51 
 
 
328 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  45.25 
 
 
317 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  42.01 
 
 
325 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  41.69 
 
 
326 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  45.65 
 
 
339 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  41.69 
 
 
326 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  44.44 
 
 
318 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  44.51 
 
 
331 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  44.51 
 
 
331 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.11 
 
 
330 aa  235  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  41.96 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  46.23 
 
 
333 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>