More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0717 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  73.21 
 
 		 290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2370  AraC family transcriptional regulator  66.54 
 
 		 284 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4276  AraC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 287 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2730  AraC family transcriptional regulator  64.98 
 
 		 283 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2744  AraC family transcriptional regulator  64.98 
 
 		 283 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2700  AraC family transcriptional regulator  64.98 
 
 		 283 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3314  AraC family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 236 aa  279  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5383  AraC family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 237 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  54.8 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4557  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.194506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1294  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0435473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3835  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 247 aa  118  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1352  helix-turn-helix domain-containing protein  30.71 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.436375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  30.99 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04860  hypothetical protein  30.43 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  26.59 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.65 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  34.06 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  34.76 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1081  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 255 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 241 aa  95.9  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  30.67 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 272 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 272 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  29.49 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6124  transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7370  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.660604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  31.58 
 
 		 267 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 		 258 aa  92.4  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  29.29 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1772  transcriptional regulator, AraC family  24.89 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  25.32 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  29.74 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13867  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 311 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0610  helix-turn-helix, AraC type  29.52 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 257 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7867  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 292 aa  89  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 278 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 287 aa  89  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 293 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 293 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2443  helix-turn-helix domain-containing protein  24.26 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  30.13 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  25.33 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  25.76 
 
 		 240 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 297 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.33 
 
 		 293 aa  86.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3559  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>