More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3835 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3835  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 284 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2370  AraC family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2730  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 283 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2700  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2744  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4276  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5383  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3314  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4557  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 274 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.194506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  33.74 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 255 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 241 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1081  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  33.83 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1352  helix-turn-helix domain-containing protein  28.95 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.436375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  27.57 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  31.68 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1294  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 252 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0435473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  32.39 
 
 		 267 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0964  AraC/XylS family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 257 aa  99.4  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.541857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  31.23 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  31.6 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0578  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  32.31 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 		 265 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  32.3 
 
 		 265 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  29.96 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  29.29 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1856  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0387007  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  32.44 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  32.11 
 
 		 262 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 267 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.6 
 
 		 259 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  27.98 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  27.13 
 
 		 273 aa  93.2  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2712  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 264 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000422  transcriptional regulator AraC/XylS family  25.18 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 244 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 333 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>