More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2404 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  586  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  73.21 
 
 		 273 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2370  AraC family transcriptional regulator  69.75 
 
 		 284 aa  394  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4276  AraC family transcriptional regulator  69.12 
 
 		 287 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2730  AraC family transcriptional regulator  70.4 
 
 		 283 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2700  AraC family transcriptional regulator  69.31 
 
 		 283 aa  387  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2744  AraC family transcriptional regulator  69.31 
 
 		 283 aa  387  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5383  AraC family transcriptional regulator  58.23 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3314  AraC family transcriptional regulator  58.3 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 270 aa  265  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4557  AraC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.194506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3835  transcriptional regulator, AraC family  40.08 
 
 		 284 aa  162  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1294  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0435473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  35.86 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 		 248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 255 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 257 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  34.63 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  28.45 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  34.98 
 
 		 261 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1081  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1352  helix-turn-helix domain-containing protein  29.87 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.436375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  27.51 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04860  hypothetical protein  31 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  31.6 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  33.33 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  33.62 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  29.87 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 272 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 272 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7370  transcriptional regulator  30.8 
 
 		 251 aa  99.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.660604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  32.05 
 
 		 262 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.09 
 
 		 259 aa  99  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  32.05 
 
 		 262 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  28.84 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  29.87 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  31.76 
 
 		 270 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  32.19 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 262 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3890  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 253 aa  96.3  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  32.16 
 
 		 259 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2338  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317534  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 254 aa  92.4  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 257 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 270 aa  92.4  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.67 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 260 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  25.1 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 244 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 257 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>