More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2700 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_2744  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2700  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2730  AraC family transcriptional regulator  99.65 
 
 		 283 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4276  AraC family transcriptional regulator  77.74 
 
 		 287 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2370  AraC family transcriptional regulator  78.45 
 
 		 284 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  69.31 
 
 		 290 aa  387  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  64.98 
 
 		 273 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5383  AraC family transcriptional regulator  54.2 
 
 		 237 aa  255  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3314  AraC family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4557  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.194506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3835  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1294  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0435473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  33.62 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1352  helix-turn-helix domain-containing protein  29.31 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.436375  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  30.47 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  24.79 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1772  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 264 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7370  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 251 aa  95.5  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.660604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  32.07 
 
 		 260 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 255 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  32.5 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7867  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6124  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 278 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 255 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.57 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 255 aa  92.8  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2443  helix-turn-helix domain-containing protein  25.42 
 
 		 258 aa  92.4  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  29.18 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13867  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  31.49 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  27.98 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  29.74 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  29.45 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  29.71 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 244 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 311 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  31.49 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 255 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 260 aa  89.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.51 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  30.93 
 
 		 266 aa  89  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>