More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7370 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7370  transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  503  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.660604  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0616  AraC family transcriptional regulator  60.91 
 
 		 247 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1856  transcriptional regulator, AraC family  36.75 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0387007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6288  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2712  transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 311 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 241 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 265 aa  131  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 450 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 262 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 288 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 292 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  37.77 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  37.77 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  33.48 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 266 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 266 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 266 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 266 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  34.35 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  30.65 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 333 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 268 aa  121  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  32.17 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  30.38 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  29.34 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  31.28 
 
 		 265 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 291 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  32.9 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  34.06 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.74 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 271 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 271 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 271 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  32.75 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  28.98 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 		 270 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  31.3 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  32.07 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  28.81 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>