More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0616 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0616  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7370  transcriptional regulator  60.91 
 
 		 251 aa  291  8e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.660604  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6288  AraC family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 268 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  36.8 
 
 		 278 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  37.66 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 265 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 322 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  36.8 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 283 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1856  transcriptional regulator, AraC family  33.62 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0387007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 293 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  38.7 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 272 aa  131  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 262 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 292 aa  131  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2339  transcriptional regulator, AraC family  36.29 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 279 aa  128  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 287 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 450 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2712  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 294 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 291 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1291  transcriptional regulator, AraC family  34.17 
 
 		 268 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 275 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  33.62 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  34.5 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  34.5 
 
 		 248 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5292  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 333 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  35.93 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  31.44 
 
 		 281 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  32.49 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3761  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  31.02 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>