More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1352 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1352  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  564  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.436375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1772  transcriptional regulator, AraC family  38.58 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6124  transcriptional regulator, AraC family  34.4 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0240  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 270 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  28.94 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  31.74 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4276  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4092  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7122  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2370  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2744  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2700  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2730  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  28.19 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13867  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  29.74 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  31.47 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  31.47 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  28.19 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 286 aa  95.9  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 283 aa  95.5  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 259 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  29.15 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6288  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  29.72 
 
 		 295 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 322 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 		 255 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5383  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  26.92 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 268 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3761  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 262 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 255 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 261 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  28.81 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1856  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0387007  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  26.19 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  27.43 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1081  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1128  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 256 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  27.69 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>