More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3314 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3314  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5383  AraC family transcriptional regulator  81.62 
 
 		 237 aa  407  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  58.3 
 
 		 290 aa  283  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 273 aa  279  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2370  AraC family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 284 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4276  AraC family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2744  AraC family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2730  AraC family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2700  AraC family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4557  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.194506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3835  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 284 aa  131  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1294  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0435473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  35.04 
 
 		 264 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 248 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  29.11 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  28.69 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 257 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1081  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 266 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 266 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3608  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0804414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  25.64 
 
 		 272 aa  92.8  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04860  hypothetical protein  29.87 
 
 		 266 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  30.38 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 271 aa  92  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 267 aa  91.7  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  30.26 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0891  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 292 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0541662  normal  0.561597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3410  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.623928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 270 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 270 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 260 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 266 aa  88.2  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3485  helix-turn-helix domain-containing protein  28.22 
 
 		 271 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  31.56 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  31.09 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1352  helix-turn-helix domain-containing protein  29.44 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.436375  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0610  helix-turn-helix, AraC type  30.3 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 280 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1856  transcriptional regulator, AraC family  26.41 
 
 		 273 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0387007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 262 aa  85.1  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 266 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 272 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 266 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 266 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 272 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2338  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317534  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5292  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  28.19 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7370  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.660604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0303  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2080  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  27.31 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  32.62 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3142  transcriptional regulator, AraC-family  31 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>