More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5544 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5544  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 463 aa  935    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258636  normal  0.142482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  37.4 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 315 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0536  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3021  AraC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0667  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 537 aa  73.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  35.92 
 
 		 328 aa  73.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  28.1 
 
 		 306 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  37.72 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 269 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  40.78 
 
 		 306 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  37.14 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  36.09 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  36.96 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  37.4 
 
 		 160 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 519 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0818  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  36.89 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  45.12 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 245 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 361 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 331 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  39 
 
 		 301 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  37.25 
 
 		 335 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  40.96 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1984  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 		 275 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2677  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 312 aa  69.7  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 300 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 349 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 204 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 544 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  39.05 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4046  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  30 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2206  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.933189  normal  0.0786322 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1911  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.27 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.61 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0023  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03507  hypothetical protein  26.61 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.702446  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.53 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2462  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4189  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0975  transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3306  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  26.34 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5113  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.52445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>