More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2390 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  398  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2387  AraC family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0159935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  42.48 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  33.95 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 223 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  36.44 
 
 		 294 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  36.94 
 
 		 296 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 272 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  34.71 
 
 		 297 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 294 aa  85.9  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 299 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  35.59 
 
 		 308 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 308 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 306 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  35.4 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3201  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 316 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 299 aa  81.3  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 304 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 278 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  37.72 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  33.06 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 678 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  33.93 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 293 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 288 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  35.4 
 
 		 304 aa  77.8  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  29.61 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  34.86 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  37.07 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  34.85 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  34.07 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 462 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 355 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 355 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 332 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 396 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 356 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  34.21 
 
 		 336 aa  75.5  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  31.45 
 
 		 396 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 410 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 355 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  33.05 
 
 		 332 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 301 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 267 aa  74.7  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 332 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 332 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  35.77 
 
 		 303 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 332 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3063  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 306 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 301 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 301 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  33.65 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0648  helix-turn-helix domain-containing protein  32.69 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.369087 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>