More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2694 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 332 aa  669    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  30.79 
 
 		 333 aa  178  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  30.03 
 
 		 377 aa  175  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  29.72 
 
 		 377 aa  169  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  34.14 
 
 		 329 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3086  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3031  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000013989  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1946  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.73017  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1747  transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2540  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000327  transcriptional regulator AraC family  25.85 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000791228  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0072  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  33.97 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  24.85 
 
 		 324 aa  92.4  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  28.5 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  28.29 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.1 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  30.63 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  27.47 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  27.19 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  24.85 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.85 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0457  transcriptional regulator, AraC family  22.77 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.761894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  25.86 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  28.66 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  36.36 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  27.56 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  33.82 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3125  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000947593  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  41.57 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  23.57 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  30.12 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  32.9 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2168  transcriptional regulator, AraC family  26.88 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  34.94 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 156 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 290 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 290 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 311 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  36.46 
 
 		 329 aa  67  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>