More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A1094 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
259 aa  541  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  99.61 
 
 
259 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
323 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 
377 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 
333 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1747  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1946  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.73017  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000327  transcriptional regulator AraC family  29.37 
 
 
322 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000791228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 
377 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0072  transcriptional regulator, AraC family  27 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  31.55 
 
 
384 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 
326 aa  75.5  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  26.06 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  28.47 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  27.45 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  26.09 
 
 
329 aa  72  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0457  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.761894  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  29.29 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3031  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000013989  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.02 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3086  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 
317 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  31.13 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2509  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00177278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2338  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  27.12 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  33.67 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3152  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  28.35 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0113977 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
321 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  21.6 
 
 
303 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3978  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 
318 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250001  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
304 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0309  transcriptional regulator  30.66 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312356  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 
322 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 
311 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  31.25 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  24.85 
 
 
312 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  31.25 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
334 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 
293 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  29.41 
 
 
334 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
334 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
334 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
319 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  21.99 
 
 
329 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  35.05 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  29.41 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  34.17 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  27.97 
 
 
530 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  33.05 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2988  transcriptional regulator  32.69 
 
 
314 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
292 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  31.82 
 
 
198 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  24.31 
 
 
338 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  29.37 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3788  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  30.23 
 
 
198 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 
326 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 
382 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 
292 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 
326 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.24 
 
 
290 aa  62.4  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 
760 aa  62.4  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  24.67 
 
 
313 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  24.67 
 
 
313 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  26.87 
 
 
322 aa  62.4  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 
328 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  24.67 
 
 
313 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
279 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  25.17 
 
 
314 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 
329 aa  62  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 
301 aa  62  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 
301 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 
265 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
319 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
300 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 
263 aa  62  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>