More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1481 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 312 aa  624  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  37.94 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  36.42 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0457  transcriptional regulator, AraC family  35.13 
 
 		 331 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.761894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 334 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 334 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  35 
 
 		 334 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  29.81 
 
 		 329 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  37.95 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  35.53 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  19.88 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  28.78 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  31.47 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0072  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  32.17 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0345  helix-turn-helix domain-containing protein  26.11 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  30.97 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3086  transcriptional regulator, AraC family  27.41 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  30.59 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  25.66 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  43.21 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  30 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  34 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  34 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  25.85 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000327  transcriptional regulator AraC family  30.93 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000791228  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  22.64 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  34 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1946  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.73017  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35070  AraC family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1747  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2960  putative transcriptional regulator  25.94 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  24.71 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  29.84 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  35.64 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  30.37 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  35.64 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2540  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1128  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  21.82 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 352 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  26.16 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  20.56 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.27 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>