More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1820 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  100 
 
 		 314 aa  630  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  47.08 
 
 		 318 aa  265  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  30.35 
 
 		 369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 341 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  29.02 
 
 		 342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  28.03 
 
 		 327 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.85 
 
 		 338 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  37.02 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  34.16 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  27.86 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  28.4 
 
 		 347 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 319 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 333 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 319 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 321 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  31.55 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  24.57 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1874  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.612156 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  36.28 
 
 		 118 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1125  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  27.01 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  30.23 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  29.1 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  27.09 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  25.1 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  23.66 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  33.56 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  26.75 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4072  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368095  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  31.03 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2565  helix-turn-helix domain-containing protein  35.64 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  34.33 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  27.15 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  29.47 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3895  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.155273 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  29.47 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  26.77 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  28.99 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  28.99 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4516  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  28.99 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3995  helix-turn-helix domain-containing protein  23.99 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>