More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0118 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 331 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  72.51 
 
 		 326 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  43.53 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4430  AraC family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330528  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4344  AraC family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4724  AraC family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  37.19 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  35.83 
 
 		 434 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1227  helix-turn-helix domain-containing protein  33.83 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0166528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3472  helix-turn-helix domain-containing protein  32.4 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.56499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1217  helix-turn-helix domain-containing protein  32.33 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1200  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 131 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 131 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 131 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  50.88 
 
 		 118 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  27.13 
 
 		 326 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  38.32 
 
 		 322 aa  92.4  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 327 aa  89.7  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  44.12 
 
 		 340 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  40.87 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 369 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 369 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 369 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  44.23 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 355 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 368 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 330 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  41.12 
 
 		 338 aa  85.9  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  31.5 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  31.33 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  37.98 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  30.38 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  37.6 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  40.15 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  45.54 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  28.82 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  37.25 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  37.25 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  36.54 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  37.25 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  37.25 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  37.25 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  36.27 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2984  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0543899 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  35.58 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  24.85 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.27 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  36.27 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  36.27 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  28.49 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>