More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2273 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  61.11 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  55.56 
 
 		 326 aa  141  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  54.1 
 
 		 331 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  58.42 
 
 		 317 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1227  helix-turn-helix domain-containing protein  55.24 
 
 		 318 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0166528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4430  AraC family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 348 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330528  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4344  AraC family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 348 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4724  AraC family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 348 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1217  helix-turn-helix domain-containing protein  54.29 
 
 		 318 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1200  AraC family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 318 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  50.47 
 
 		 434 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  58.1 
 
 		 331 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 329 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3472  helix-turn-helix domain-containing protein  43.97 
 
 		 330 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.56499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  45.28 
 
 		 338 aa  90.1  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 369 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 369 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 369 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 332 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 330 aa  87  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  40.95 
 
 		 369 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 368 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 327 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  43.27 
 
 		 322 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 321 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  37.01 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 340 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 324 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 335 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 319 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  36.61 
 
 		 327 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 355 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 341 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 355 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 355 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 341 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 333 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 352 aa  74.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 341 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  35.29 
 
 		 319 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 336 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 352 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 344 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 327 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  36.22 
 
 		 338 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 318 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 373 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 329 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 324 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  40.23 
 
 		 342 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 329 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 333 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 330 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 341 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 328 aa  70.5  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 322 aa  70.5  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 330 aa  70.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 323 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2651  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0391115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  32.29 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  40.37 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 344 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  37 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  35.56 
 
 		 347 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 321 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 332 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 324 aa  68.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 392 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 342 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 338 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 351 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 344 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 344 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 341 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 351 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>