More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0336 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  634    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3472  helix-turn-helix domain-containing protein  41.48 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.56499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  39.81 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  37.19 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 434 aa  168  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  37.3 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4430  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330528  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4724  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4344  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1227  helix-turn-helix domain-containing protein  46.15 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0166528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1200  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815241  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1217  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  58.42 
 
 		 131 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  58.42 
 
 		 131 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  58.42 
 
 		 131 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2365  hypothetical protein  36.73 
 
 		 205 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  46.73 
 
 		 118 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  28.26 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.49 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  40.91 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  34.06 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.03 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.46 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  23.27 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 362 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  27.91 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  26.27 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  21.89 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  25.32 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  26.62 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  34.31 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4523  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.027207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2651  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0391115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  33.57 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  28.87 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  26.53 
 
 		 530 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  31.07 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  29.86 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  26.9 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  26.9 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4516  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  26.9 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>