More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4704 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 274 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1451  transcriptional regulator, AraC family protein  28.57 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0743909  normal  0.362871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1817  transcriptional regulator, AraC family protein  28.57 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.246217  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1467  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.145729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1486  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.012343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1393  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01665  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.17 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01654  hypothetical protein  28.17 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1935  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1946  transcriptional regulator, AraC family  27.38 
 
 		 303 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.192766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1912  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 303 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1899  transcriptional regulator, AraC family  27.38 
 
 		 303 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1500  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 303 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.831009  normal  0.0187399 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2412  transcriptional regulator, AraC family  27.38 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  29.03 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1988  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 194 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  hitchhiker  0.00402915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5736  transcriptional regulator, AraC family  29.04 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458087  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  26.89 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  36.79 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  27.61 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3586  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.64 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  25.94 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 277 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 303 aa  72  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 312 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 149 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  33.58 
 
 		 131 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  25.71 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  25.1 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.75 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3119  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00676861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 544 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  35.51 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 548 aa  68.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  33.13 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  31.62 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1419  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 		 1201 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  36.79 
 
 		 198 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  28.89 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  33.68 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>