More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1393 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1393  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
303 aa  631  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1946  transcriptional regulator, AraC family  67.8 
 
 
303 aa  434  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.192766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1912  AraC family transcriptional regulator  67.8 
 
 
303 aa  434  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2412  transcriptional regulator, AraC family  67.8 
 
 
303 aa  434  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1500  AraC family transcriptional regulator  67.8 
 
 
303 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.831009  normal  0.0187399 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1899  transcriptional regulator, AraC family  67.8 
 
 
303 aa  434  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01665  predicted DNA-binding transcriptional regulator  67.12 
 
 
303 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1467  AraC family transcriptional regulator  69.52 
 
 
296 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.145729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1451  transcriptional regulator, AraC family protein  69.52 
 
 
296 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0743909  normal  0.362871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1935  AraC family transcriptional regulator  67.46 
 
 
303 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0147604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1817  transcriptional regulator, AraC family protein  69.52 
 
 
296 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.246217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01654  hypothetical protein  67.12 
 
 
303 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1486  AraC family transcriptional regulator  68.84 
 
 
296 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.012343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1988  AraC family transcriptional regulator  73.33 
 
 
194 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  hitchhiker  0.00402915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  26.91 
 
 
274 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  27.06 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  24.35 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000984991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 
513 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  23.95 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  22.74 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  33.05 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  34.51 
 
 
240 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  31.33 
 
 
530 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  31.36 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  23.42 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  22.27 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 
1201 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  27.69 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  30.51 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
532 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1419  transcriptional regulator  27.27 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  24.64 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 
162 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 
760 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  32.38 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  32.38 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1288  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0436335  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  32.38 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  29.73 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  26.88 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  29.41 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  29.03 
 
 
361 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  36.73 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05185  hypothetical protein  30.3 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
276 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 
300 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  23.57 
 
 
285 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  33.04 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  28.81 
 
 
537 aa  66.2  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001306  putative ARAC-type regulatory protein  29.29 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
535 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
414 aa  65.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  35.35 
 
 
507 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  35.35 
 
 
507 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  29.81 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  23.48 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  33.68 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  20.68 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  30.1 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  33.01 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 
316 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 
306 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>