More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0841 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 300 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  24.37 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  33.9 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  26.24 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  27.84 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  29.12 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  27.06 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 544 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  22.75 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  41.35 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01665  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.27 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  23.79 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01654  hypothetical protein  36.27 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 548 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1935  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147604 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  32 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 533 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1984  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 513 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3907  AraC family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.869248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 523 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  25.94 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  32.37 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  40.38 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3306  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 532 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1817  transcriptional regulator, AraC family protein  35.29 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.246217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1988  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  hitchhiker  0.00402915 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1451  transcriptional regulator, AraC family protein  35.29 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0743909  normal  0.362871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1467  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.145729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03387  hypothetical protein  21.19 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03436  putative regulatory protein  21.19 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1946  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.192766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1899  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3086  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000257264  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3030  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3328  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1500  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.831009  normal  0.0187399 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1912  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2412  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4950  transcriptional regulator, AraC family  21.19 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3298  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 198 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4432  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 392 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3111  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  33.7 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  28.04 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  31 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>