More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6249 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 356 aa  727    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  86.2 
 
 		 327 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  82.82 
 
 		 327 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  74.06 
 
 		 330 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  60.6 
 
 		 331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  54.55 
 
 		 331 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  52.63 
 
 		 329 aa  315  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 333 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 333 aa  295  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 331 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  43.44 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  43.81 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 		 327 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3266  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 354 aa  175  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 326 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 348 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 349 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 326 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 329 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 251 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  53.47 
 
 		 355 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  27.03 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.04 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  28.31 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 360 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  29.54 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 314 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 336 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  28.48 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  26.93 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  29.58 
 
 		 327 aa  99.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 322 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  25.46 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 358 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  28.04 
 
 		 369 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 369 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  28.04 
 
 		 374 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 330 aa  92.8  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4365  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 324 aa  92.4  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 346 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 346 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 346 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 343 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  26.99 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 326 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 326 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  25.85 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  25.3 
 
 		 367 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  28.13 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  24.19 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  29.97 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  25.66 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  24.93 
 
 		 367 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>