More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1098 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  672    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  84.1 
 
 		 327 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  82.82 
 
 		 356 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  74.31 
 
 		 330 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  56.52 
 
 		 331 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  55.34 
 
 		 331 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  51.61 
 
 		 329 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 333 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 333 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 333 aa  241  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  44.66 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  43.83 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  41.64 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 330 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 333 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  35.73 
 
 		 354 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 356 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3266  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 345 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.07 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  52.94 
 
 		 355 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  27.81 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  29.02 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 338 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  29.3 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  28.36 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  28.84 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  28.84 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.84 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  26.43 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  28.31 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 356 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  25.55 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 322 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  30.46 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 358 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 		 332 aa  92.4  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  30.06 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 338 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5810  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 327 aa  89.4  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 326 aa  89.4  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  27.15 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>