More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2197 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
314 aa  628  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  75.72 
 
 
315 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  74.2 
 
 
315 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  74.52 
 
 
315 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  74.52 
 
 
315 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  74.12 
 
 
315 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  61.39 
 
 
342 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  58.1 
 
 
313 aa  362  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  56.73 
 
 
313 aa  338  9e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  54.6 
 
 
316 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0092  AraC family transcriptional regulator  53.21 
 
 
312 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0049  transcriptional regulator, AraC family  48.39 
 
 
322 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  50.48 
 
 
320 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  50.48 
 
 
320 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  50.48 
 
 
320 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0089  AraC family transcriptional regulator  53.21 
 
 
312 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 
340 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  46.2 
 
 
331 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  46.71 
 
 
328 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  47.28 
 
 
321 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  45.11 
 
 
323 aa  258  6e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  45.91 
 
 
350 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 
320 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  45.71 
 
 
327 aa  255  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  44.38 
 
 
321 aa  255  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  47.44 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
314 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  47.17 
 
 
334 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  48.74 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  44.41 
 
 
318 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  47.08 
 
 
306 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  44.65 
 
 
330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  42.49 
 
 
326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  47.59 
 
 
320 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  44.94 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  43.17 
 
 
346 aa  242  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  44.1 
 
 
347 aa  242  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  44.13 
 
 
320 aa  238  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  41.64 
 
 
342 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  43.27 
 
 
329 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
326 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  40.87 
 
 
322 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  42.55 
 
 
326 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  43.53 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  43.08 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  41.48 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  42.01 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  42.86 
 
 
326 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  42.86 
 
 
326 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  44.23 
 
 
329 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  44.59 
 
 
322 aa  232  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  43.09 
 
 
362 aa  232  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  44.69 
 
 
333 aa  232  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  45.28 
 
 
332 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  42.17 
 
 
333 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  42.26 
 
 
317 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  44.73 
 
 
326 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  42.12 
 
 
338 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  43.63 
 
 
317 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  43.73 
 
 
346 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  51.3 
 
 
322 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  41.99 
 
 
333 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  40.45 
 
 
318 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  44.06 
 
 
325 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  43.21 
 
 
337 aa  225  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  42.12 
 
 
338 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  42.17 
 
 
344 aa  225  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 
356 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  43.31 
 
 
324 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 
335 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  42.99 
 
 
324 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  42.68 
 
 
352 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  43.31 
 
 
324 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 
335 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  42.99 
 
 
320 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 
331 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  42.99 
 
 
320 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 
331 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  44.22 
 
 
333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  43.38 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
320 aa  222  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  43.95 
 
 
324 aa  222  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  41.48 
 
 
341 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  41.48 
 
 
341 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  39.43 
 
 
335 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  44.41 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  39.12 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  42.68 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  42.99 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  45.74 
 
 
331 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  43.61 
 
 
321 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  42.36 
 
 
320 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 
333 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 
333 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 
337 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  50.4 
 
 
318 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  50.4 
 
 
356 aa  215  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  40.89 
 
 
325 aa  215  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>