More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3031 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  100 
 
 
333 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  93.67 
 
 
333 aa  634    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  59.76 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  59.37 
 
 
331 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  55.69 
 
 
330 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  57.14 
 
 
329 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  54.38 
 
 
333 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  56.56 
 
 
326 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  55.05 
 
 
335 aa  358  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  56 
 
 
332 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  53.53 
 
 
318 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  53.53 
 
 
318 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  53.53 
 
 
318 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  53.53 
 
 
318 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  53.04 
 
 
321 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  53.53 
 
 
318 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  54.49 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  53.21 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  54.84 
 
 
324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  54.19 
 
 
324 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  54.19 
 
 
320 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  54.19 
 
 
320 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  54.52 
 
 
324 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  52.4 
 
 
321 aa  331  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  52.08 
 
 
321 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  53.55 
 
 
320 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  53.21 
 
 
318 aa  328  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  53.82 
 
 
322 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  52.23 
 
 
329 aa  315  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  48.08 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  47.76 
 
 
317 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  47.32 
 
 
333 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  47.12 
 
 
350 aa  292  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  48.08 
 
 
326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  48.2 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  46.86 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  48.4 
 
 
334 aa  282  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  44.69 
 
 
320 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  46.3 
 
 
328 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  47.44 
 
 
338 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  45.02 
 
 
341 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  45.02 
 
 
341 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  47.19 
 
 
338 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  46.79 
 
 
323 aa  276  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 
342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 
318 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  47.12 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  45.37 
 
 
347 aa  269  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  44.27 
 
 
326 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  45.79 
 
 
333 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  46.41 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 
322 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 
333 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  45.19 
 
 
320 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 
325 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  43.63 
 
 
325 aa  261  8.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  44.51 
 
 
321 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  44.23 
 
 
324 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  44.16 
 
 
330 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  46.5 
 
 
332 aa  258  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  46.95 
 
 
325 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  47.45 
 
 
327 aa  255  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  39.3 
 
 
316 aa  255  8e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  43.41 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  45.95 
 
 
346 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  43.27 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  47.44 
 
 
337 aa  252  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  43.27 
 
 
326 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  43.27 
 
 
326 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  42.95 
 
 
317 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  39.88 
 
 
335 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  43.27 
 
 
326 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  39.88 
 
 
335 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  39.88 
 
 
335 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 
362 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  47.44 
 
 
331 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  48.36 
 
 
322 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  38.54 
 
 
317 aa  245  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  41.49 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 
335 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  43.87 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  42.36 
 
 
317 aa  242  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  44.3 
 
 
328 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  41.38 
 
 
350 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  41.49 
 
 
334 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  46.96 
 
 
313 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.59 
 
 
330 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  43.91 
 
 
313 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 
318 aa  238  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
349 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  42.95 
 
 
321 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 
332 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  43.27 
 
 
344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 
327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  41.49 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  41.49 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  38.59 
 
 
321 aa  233  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  43.17 
 
 
337 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>