More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5345 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 318 aa  630  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  99.37 
 
 		 356 aa  626  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  66.35 
 
 		 314 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  50.32 
 
 		 327 aa  286  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6996  transcriptional regulator, AraC family  51.13 
 
 		 338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  50.31 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  49.85 
 
 		 339 aa  279  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  48.09 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  48.11 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  51.72 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  49.54 
 
 		 319 aa  258  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  49.69 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  49.52 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  49.21 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  45.86 
 
 		 321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 316 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  44.3 
 
 		 324 aa  251  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  45.91 
 
 		 332 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2471  transcriptional regulator, AraC family  49.37 
 
 		 327 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  44.18 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  45.71 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  44.27 
 
 		 318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 356 aa  241  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  41.53 
 
 		 322 aa  242  7.999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  43.87 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  47.7 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 331 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1996  transcriptional regulator  47.45 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  41.21 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  42.44 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.13 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  43.55 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  45.77 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  45.26 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  45.77 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  45.77 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  41.53 
 
 		 317 aa  233  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 335 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 315 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 315 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  43.67 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  44.51 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2855  AraC family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 258 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  44.17 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  44.29 
 
 		 324 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  44.65 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  43.97 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  44.24 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  43.93 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 335 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  41.42 
 
 		 322 aa  229  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  43.97 
 
 		 320 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  43.97 
 
 		 320 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  43.88 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  43.88 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  43.88 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  43.88 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  43.88 
 
 		 318 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0049  transcriptional regulator, AraC family  42.36 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  43.95 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 349 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  41.73 
 
 		 321 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 335 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  41.64 
 
 		 331 aa  225  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  42.46 
 
 		 350 aa  225  9e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  44 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  46.98 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  42.09 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  42.02 
 
 		 334 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  41.03 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  43.55 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  42.81 
 
 		 333 aa  222  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  38.92 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  43.68 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  41.69 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  41.46 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  38.92 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  43.13 
 
 		 342 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3331  transcriptional regulator, AraC family  48.94 
 
 		 348 aa  219  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  44.96 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  39.55 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>