More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3186 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  692    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  55.63 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  51.27 
 
 		 318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  52.41 
 
 		 323 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  52.1 
 
 		 317 aa  344  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  47.76 
 
 		 316 aa  329  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 350 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 341 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 341 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  45.98 
 
 		 317 aa  305  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  45.66 
 
 		 317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  46.48 
 
 		 338 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 338 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 342 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 330 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 333 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  46.23 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 331 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 331 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  45.4 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 335 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  39.03 
 
 		 335 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  40.44 
 
 		 342 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  38.39 
 
 		 326 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  37.7 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  40.76 
 
 		 347 aa  241  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  37.38 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  37.74 
 
 		 329 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  40.84 
 
 		 321 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  36.86 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  37.3 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  38.59 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 346 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  39.23 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  35.58 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  39.65 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  36.33 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  37.58 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  37.58 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  38.29 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  37.58 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  37.58 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  37.58 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  37.58 
 
 		 318 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  37.74 
 
 		 350 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 340 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  35.95 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  39.65 
 
 		 324 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  38.51 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 		 333 aa  226  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  39.3 
 
 		 324 aa  225  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  38.59 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  38.6 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  38.6 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  38.59 
 
 		 329 aa  222  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 320 aa  222  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  37.03 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  38.59 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  36.77 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  38.25 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  36.81 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  37.25 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 321 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2725  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  37.18 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 326 aa  215  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  37.26 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  36.74 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  37.26 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  37.26 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  36.39 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  36.77 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  36.66 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  35.28 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  38.68 
 
 		 328 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  35.14 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  35.76 
 
 		 317 aa  205  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  34.86 
 
 		 328 aa  205  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  36.77 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>