More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1531 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 316 aa  611  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 350 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 320 aa  302  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  51.27 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  53.97 
 
 		 325 aa  285  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 335 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 335 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 335 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  49.68 
 
 		 331 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  49.68 
 
 		 331 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  45.66 
 
 		 335 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 333 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  49.04 
 
 		 317 aa  278  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  49.04 
 
 		 317 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  53.31 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  49.2 
 
 		 338 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 341 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 331 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  44.52 
 
 		 318 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  48.73 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  46.35 
 
 		 328 aa  258  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  48.4 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  46.46 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2725  transcriptional regulator, AraC family  49.68 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  40.76 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  45.83 
 
 		 321 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  45.71 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  47.91 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  48.01 
 
 		 352 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  46.71 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  45.77 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  49.23 
 
 		 332 aa  243  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  43.53 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  40.94 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  45.54 
 
 		 326 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  43.61 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 321 aa  237  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  43.63 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  47.5 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  47.2 
 
 		 334 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  45.62 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  48.75 
 
 		 339 aa  232  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5972  transcriptional regulator, AraC family  45.91 
 
 		 343 aa  232  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  47.13 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  45.74 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  42.37 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  38.59 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  49.22 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  43.31 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 356 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  41.21 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  45.11 
 
 		 333 aa  225  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  41.4 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  39.87 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  43.86 
 
 		 306 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 		 333 aa  221  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  41.82 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  46.3 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  43.63 
 
 		 332 aa  218  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  40.88 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  44.73 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  38.66 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  44.73 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  44.73 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  44.73 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  43.77 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  44.73 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  44.09 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  41.56 
 
 		 321 aa  215  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  39.68 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  43.08 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  43.08 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  43.08 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  42.41 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  43.08 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  41.51 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  43.08 
 
 		 318 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  43.08 
 
 		 318 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>