More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3780 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  99.1 
 
 		 335 aa  693    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 335 aa  697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  99.1 
 
 		 335 aa  691    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  98.81 
 
 		 335 aa  689    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  56.11 
 
 		 320 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  51.27 
 
 		 348 aa  338  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 342 aa  332  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  48.74 
 
 		 338 aa  319  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 338 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 341 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 341 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  47.77 
 
 		 317 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  51.92 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  47.13 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  47.3 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  47.3 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  49.37 
 
 		 325 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  43.79 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  43.45 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 340 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  41.35 
 
 		 318 aa  272  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  43.12 
 
 		 342 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  43.85 
 
 		 327 aa  268  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 326 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 317 aa  261  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  43.4 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  42.36 
 
 		 332 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  45.66 
 
 		 316 aa  260  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 323 aa  259  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  44.73 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  37.85 
 
 		 333 aa  255  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 333 aa  255  9e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 326 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  40 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 316 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 326 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 326 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2725  transcriptional regulator, AraC family  42.68 
 
 		 320 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  38.92 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  41.53 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  40.51 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 		 313 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  39.42 
 
 		 330 aa  249  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  40.06 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  41.46 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  37.46 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  37.95 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  39.81 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 339 aa  242  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  40.32 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 321 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  40.65 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  41.85 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 318 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 327 aa  235  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  38.56 
 
 		 350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  40.18 
 
 		 329 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5972  transcriptional regulator, AraC family  38.22 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  39.12 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  39.09 
 
 		 317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  41.96 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  38.49 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  37.82 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  38.34 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  42.37 
 
 		 306 aa  228  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2471  transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  39.1 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  36.28 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  37.66 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  36.66 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  37.94 
 
 		 321 aa  222  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  37.34 
 
 		 324 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  36.45 
 
 		 317 aa  222  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  36.33 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  35.96 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  36.33 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  36.33 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  36.33 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>