More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9264 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  100 
 
 
328 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  66.14 
 
 
352 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  60.82 
 
 
330 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2471  transcriptional regulator, AraC family  66.56 
 
 
327 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117682  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  62.07 
 
 
332 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  59.38 
 
 
332 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  60.38 
 
 
339 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  57.1 
 
 
327 aa  357  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  55.94 
 
 
327 aa  357  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  57.32 
 
 
337 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  58.31 
 
 
322 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  67.7 
 
 
367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  50.47 
 
 
321 aa  309  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  50.95 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  47.96 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  51.9 
 
 
314 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  48.26 
 
 
350 aa  295  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  47.8 
 
 
342 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  45.62 
 
 
333 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  47.78 
 
 
346 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  50.31 
 
 
356 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  44.62 
 
 
325 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  50.47 
 
 
318 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 
326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  45.31 
 
 
333 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  45.43 
 
 
326 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2855  AraC family transcriptional regulator  64.65 
 
 
258 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  46.06 
 
 
326 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  46.06 
 
 
326 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  47.19 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  44.79 
 
 
338 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  47.53 
 
 
323 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  46.86 
 
 
324 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  49.21 
 
 
331 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  43.08 
 
 
329 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  44.16 
 
 
338 aa  265  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  43.81 
 
 
341 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  43.81 
 
 
341 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  45.91 
 
 
346 aa  264  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  44.24 
 
 
321 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  48.46 
 
 
313 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  45.91 
 
 
328 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  44.27 
 
 
330 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  45.62 
 
 
321 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  46.54 
 
 
317 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  46.08 
 
 
356 aa  262  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  48.26 
 
 
337 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  45.2 
 
 
340 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  43.71 
 
 
326 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  43.61 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  44.72 
 
 
320 aa  258  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  44.41 
 
 
306 aa  258  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  44.3 
 
 
333 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  46.44 
 
 
333 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 
335 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  42.54 
 
 
335 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  44.3 
 
 
333 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.4 
 
 
330 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 
335 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  45.6 
 
 
317 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  46.85 
 
 
319 aa  255  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  42.54 
 
 
333 aa  255  8e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  44.9 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  46.35 
 
 
342 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  49.69 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 
326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  45.51 
 
 
342 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  41.96 
 
 
335 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  46.25 
 
 
362 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  43.22 
 
 
321 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  43.85 
 
 
318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  43.81 
 
 
321 aa  252  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  43.89 
 
 
331 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 
332 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  43.31 
 
 
329 aa  248  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  44.65 
 
 
325 aa  248  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 
349 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  44 
 
 
333 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  43.61 
 
 
324 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  44.41 
 
 
320 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  43.53 
 
 
318 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  43.53 
 
 
318 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  43.53 
 
 
318 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  44.44 
 
 
324 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  43.53 
 
 
318 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  44.13 
 
 
320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  43.81 
 
 
320 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  43.81 
 
 
320 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  43.49 
 
 
324 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  41.36 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  43.22 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  43.26 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  43.49 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  43.22 
 
 
318 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  43.44 
 
 
313 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  43.65 
 
 
331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  43.65 
 
 
331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  43.03 
 
 
350 aa  242  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  43.18 
 
 
334 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0049  transcriptional regulator, AraC family  43.4 
 
 
322 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>