More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4516 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4516  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0639  transcriptional regulator, AraC family  41.72 
 
 		 350 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  40.76 
 
 		 354 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1125  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  37.54 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  38.79 
 
 		 329 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  31.1 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  29.45 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 330 aa  99.4  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  29.09 
 
 		 321 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  28.34 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 327 aa  89  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.47 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  28.79 
 
 		 340 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  30.5 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4177  helix-turn-helix domain-containing protein  25.61 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128864  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  42.71 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  44.79 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  25.76 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0737  helix-turn-helix domain-containing protein  41.74 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.396346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2026  AraC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  23.72 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  24.93 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  27.33 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  44.21 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.47 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  23.6 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  27.05 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  28.48 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6712  AraC family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1567  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  26.32 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6477  AraC family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>