More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6668 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 324 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2565  helix-turn-helix domain-containing protein  50.54 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  26.89 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  48.31 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  44.83 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  44.83 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  47.13 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  35.05 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 131 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 131 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 131 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  44.94 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0963  transcriptional regulator EutR  26.13 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  37.69 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  39.77 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  42.05 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0639  transcriptional regulator, AraC family  37.12 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1113  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.478507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  40.38 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6432  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  23.55 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2026  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  39.08 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  44.94 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  24.21 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0737  helix-turn-helix domain-containing protein  30.14 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.396346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  24.21 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  40 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  24.21 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  23.17 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  24.21 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  24.21 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  23.17 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1205  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1361  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2470  AraC family transcription regulator  32.33 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0288941  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0344  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.7264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  23.17 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  23.17 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1278  AraC family transcription regulator  32.33 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0947  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0977731  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0624  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.17 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  23.17 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  23.17 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4772  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1533  putative ethanolamine operon transcriptional regulator  32.33 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.56366  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  33.97 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  23.55 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  40.23 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4006  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  30.57 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2987  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1550  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  30.57 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0135  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>