More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0134 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
343 aa  685    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  88.6 
 
 
344 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  92.07 
 
 
351 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  88.89 
 
 
344 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  92.07 
 
 
351 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  89.61 
 
 
338 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  87.43 
 
 
344 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  78.42 
 
 
342 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3052  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  78.21 
 
 
342 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.680184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2987  AraC family transcriptional regulator  78.21 
 
 
342 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0135  AraC family transcriptional regulator  78.21 
 
 
342 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3935  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  77.91 
 
 
342 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1550  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  78.21 
 
 
342 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3318  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  78.21 
 
 
342 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4006  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  77.91 
 
 
342 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  65.9 
 
 
352 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  64.59 
 
 
349 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  61.31 
 
 
338 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  48.09 
 
 
347 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  45.29 
 
 
330 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 
324 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  36.5 
 
 
350 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0963  transcriptional regulator EutR  39.05 
 
 
347 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.5 
 
 
350 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  36.5 
 
 
350 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  36.2 
 
 
350 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  37.99 
 
 
350 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  36.28 
 
 
350 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  37.99 
 
 
350 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  37.99 
 
 
350 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  37.99 
 
 
350 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  37.99 
 
 
350 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  36.5 
 
 
350 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  36.2 
 
 
350 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  35.99 
 
 
350 aa  203  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  36.5 
 
 
350 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  37.7 
 
 
327 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2415  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.458311  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0275  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  33.84 
 
 
351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 
373 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  32.48 
 
 
322 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
335 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  31.75 
 
 
354 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
335 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
335 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0600  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 
320 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1113  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
325 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.478507 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 
332 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  35.41 
 
 
334 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3579  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5063  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5221  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3304  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  36.74 
 
 
342 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 
345 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
320 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 
339 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
321 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4998  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
318 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681619  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 
337 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4473  AraC family transcriptional regulator  32.57 
 
 
320 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4772  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1533  putative ethanolamine operon transcriptional regulator  35.39 
 
 
312 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.56366  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4684  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 
312 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4160  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 
312 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301949  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5506  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
312 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2651  AraC family transcriptional regulator  31.92 
 
 
318 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0391115  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3590  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
332 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4777  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
332 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1361  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
312 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2470  AraC family transcription regulator  33.44 
 
 
312 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0288941  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0624  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
312 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79157  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0344  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
312 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.7264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0947  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
312 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0977731  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1278  AraC family transcription regulator  33.44 
 
 
339 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1205  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
339 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0937  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3824  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000347753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4072  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
330 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6712  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 
314 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6477  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 
314 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  28.2 
 
 
319 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 
302 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 
299 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2565  helix-turn-helix domain-containing protein  29.37 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 
327 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  39.44 
 
 
342 aa  86.3  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
330 aa  86.3  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  34.75 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  38.83 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 
355 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>