More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3427 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 329 aa  663    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  44.34 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  37.58 
 
 		 369 aa  215  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 341 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 355 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 355 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  36.34 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  36.53 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  35.56 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 362 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  35.51 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  35.58 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  33.86 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.58 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  33.65 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  33.23 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 341 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.48 
 
 		 318 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.63 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  29.32 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  44.3 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3895  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.155273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  28.84 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  32.92 
 
 		 405 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  32.03 
 
 		 330 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3625  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  42.67 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  26.62 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  28.78 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5361  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835792  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 326 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  27.46 
 
 		 327 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3531  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.342116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2490  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0639  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  46.23 
 
 		 118 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  30.45 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4516  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  37.13 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  33.51 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4430  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330528  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4344  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4724  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2306  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 326 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  31.63 
 
 		 198 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  26.06 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  27.2 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3995  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>