More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3631 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  100 
 
 		 318 aa  637    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  47.08 
 
 		 314 aa  265  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 329 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  28.39 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  31.77 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.33 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 341 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 368 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  27.81 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 355 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 355 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  29.97 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 319 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  26.71 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  25.62 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 		 118 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  25.2 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  26.64 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  37.42 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  34.93 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  35.34 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0335  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  26.03 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  26.4 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 392 aa  72.4  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  34.21 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3895  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.155273 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  25.9 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1072  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  35.46 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  26.48 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  35.34 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4430  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330528  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4344  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  24.61 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  40.23 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  33.09 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4724  AraC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>