More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1832 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  100 
 
 		 342 aa  701    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  36.51 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  34.71 
 
 		 321 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  34.83 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 329 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  30.91 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  33.54 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  32.68 
 
 		 354 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 319 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  28.96 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3895  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.155273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  29.39 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.09 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  32.49 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  29.39 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  32.3 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  31.7 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  28.91 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  28.05 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  32.11 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0639  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3625  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  30.49 
 
 		 405 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 389 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5361  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835792  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 339 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.02 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2490  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  26.16 
 
 		 329 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  30.83 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1125  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4516  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  28.33 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3531  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.342116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.39 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  28.92 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2984  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0543899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 323 aa  105  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0335  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1874  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.612156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  37.59 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  29.88 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  28.33 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32060  transcriptional regulator XylS  29.3 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  29.38 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>