More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0233 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
334 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  100 
 
 
405 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
389 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
334 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
341 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
334 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
321 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  93.71 
 
 
341 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  74.29 
 
 
321 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  75.55 
 
 
319 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  75.79 
 
 
319 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  74.92 
 
 
319 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  74.61 
 
 
319 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  73.98 
 
 
321 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  73.98 
 
 
319 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  57.1 
 
 
321 aa  340  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  55.97 
 
 
321 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
327 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  43.77 
 
 
326 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  40.88 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 
355 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  33.13 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
341 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
341 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 
316 aa  133  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 
341 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  35.03 
 
 
329 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 
392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 
327 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 
368 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 
330 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 
327 aa  116  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 
333 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  32.21 
 
 
347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  27.69 
 
 
319 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  31.41 
 
 
358 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  30.21 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 
328 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 
333 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  26.13 
 
 
326 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 
334 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
330 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
352 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  32.16 
 
 
335 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 
318 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  30.28 
 
 
327 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 
343 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 
318 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 
362 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 
318 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  26.25 
 
 
338 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 
354 aa  99.8  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 
336 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4177  helix-turn-helix domain-containing protein  29.25 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128864  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  48.54 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0335  AraC family transcriptional regulator  32.15 
 
 
355 aa  96.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  28.42 
 
 
330 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 
318 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  49.51 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  49 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  48.54 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  47.57 
 
 
343 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  46.9 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 
326 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  46.6 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0639  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  46 
 
 
339 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  45.63 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 
322 aa  90.1  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  23.3 
 
 
321 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  26.91 
 
 
329 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32060  transcriptional regulator XylS  31.33 
 
 
318 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  31.03 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  27.15 
 
 
369 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4516  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 
339 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  29.32 
 
 
340 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  21.99 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  30.04 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 
369 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 
369 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2984  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 
336 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0543899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 
369 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
344 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  48.98 
 
 
198 aa  86.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  25.39 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  38.41 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.97 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>