More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1471 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 327 aa  669    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 341 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 341 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  28.91 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  31.85 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  29.39 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  29.93 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  30.15 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 326 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  30.71 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 		 325 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 343 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  25.8 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  28.17 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  27.76 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 329 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  30.31 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  26.73 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  26.32 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  26.28 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 392 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  26.92 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0639  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  28.31 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3895  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 324 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.155273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  30.42 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  29.39 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3531  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 324 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.342116 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 321 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2490  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 324 aa  99.4  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 341 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  26.07 
 
 		 405 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5361  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835792  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3625  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 341 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32060  transcriptional regulator XylS  28.35 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  26.1 
 
 		 369 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 327 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0335  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 355 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  23.57 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 330 aa  92.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  25.23 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.67 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  25.18 
 
 		 326 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  35.77 
 
 		 340 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  26.92 
 
 		 358 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4895  AraC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 349 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.259797 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3995  helix-turn-helix domain-containing protein  37.74 
 
 		 318 aa  86.3  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4516  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2984  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0543899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  40.78 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>